Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cspp1B2RX88 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cspp1B2RX88 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms