Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Clrn2B2RVW2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
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