Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Brpf1B2RRD7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms