Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Uhrf1bp1B2KF50 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms