Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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H2-M5A7VMS3 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
H2-M5A7VMS3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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H2-M5A7VMS3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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H2-M5A7VMS3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
H2-M5A7VMS3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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