Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm6880A3KG45 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm6880A3KG45 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm6880A3KG45 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Gm6880A3KG45 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm6880A3KG45 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms