Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2al1jA2BFR3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms