Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Syndig1A2ANU3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Syndig1A2ANU3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms