Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ambra1A2AH22 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms