Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Frmpd4A2AFR3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms