Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trip6Q9Z1Y4 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trip6Q9Z1Y4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms