Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tnfsf13bQ9WU72 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms