Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Psmb3Q9R1P1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Psmb3Q9R1P1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms