Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

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Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Nek3Q9R0A5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Nek3Q9R0A5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Nek3Q9R0A5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Nek3Q9R0A5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Nek3Q9R0A5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Nek3Q9R0A5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Nek3Q9R0A5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nek3Q9R0A5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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