Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Prkab1Q9R078 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms