Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

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Length 917 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ercc4Q9QZD4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ercc4Q9QZD4 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Ercc4Q9QZD4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ercc4Q9QZD4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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