Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Znf354bQ9QXT9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf354bQ9QXT9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf354bQ9QXT9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf354bQ9QXT9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf354bQ9QXT9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Znf354bQ9QXT9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf354bQ9QXT9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf354bQ9QXT9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf354bQ9QXT9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf354bQ9QXT9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf354bQ9QXT9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf354bQ9QXT9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf354bQ9QXT9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf354bQ9QXT9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf354bQ9QXT9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Znf354bQ9QXT9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms