Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChmQ9QXG2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms