Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Col5a3Q9JLI2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Col5a3Q9JLI2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Col5a3Q9JLI2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Col5a3Q9JLI2 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Col5a3Q9JLI2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Col5a3Q9JLI2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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