Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nectin1Q9JKF6 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nectin1Q9JKF6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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