Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tnfrsf23Q9ER63 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tnfrsf23Q9ER63 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms