Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prpf4Q9DAW6 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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