Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rnf138rt1Q9D9M9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms