Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Snx5Q9D8U8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Snx5Q9D8U8 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Snx5Q9D8U8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms