Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Derl3Q9D8K3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms