Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc94Q9D6J3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms