Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PudpQ9D5U5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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