Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pramef12Q9D2F1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms