Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Mms19Q9D071 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms