Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL6

Mrpl35, 39S ribosomal protein L35, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl35Q9CQL6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Mrpl35Q9CQL6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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