Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE7

Ergic3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic3Q9CQE7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ergic3Q9CQE7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms