Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Atp6v0e1Q9CQD8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Atp6v0e1Q9CQD8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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Atp6v0e1Q9CQD8 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Atp6v0e1Q9CQD8 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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