Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rab5aQ9CQD1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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