Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Bhlhe41Q99PV5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Bhlhe41Q99PV5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms