Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1aQ99L02 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pagr1aQ99L02 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms