Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ciao1Q99KN2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ciao1Q99KN2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ciao1Q99KN2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Ciao1Q99KN2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ciao1Q99KN2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ciao1Q99KN2 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Ciao1Q99KN2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ciao1Q99KN2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms