Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ctu1Q99J10 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ctu1Q99J10 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Ctu1Q99J10 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ctu1Q99J10 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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