Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Cldn16Q925N4 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms