Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atl3Q91YH5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atl3Q91YH5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms