Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usb1Q91W78 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usb1Q91W78 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms