Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cabp4Q8VHC5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cabp4Q8VHC5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms