Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hecw1Q8K4P8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hecw1Q8K4P8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms