Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sde2Q8K1J5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sde2Q8K1J5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms