Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8C1

Rtp1, Receptor-transporting protein 1, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp1Q8C8C1 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rtp1Q8C8C1 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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