Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Usp20Q8C6M1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Usp20Q8C6M1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Usp20Q8C6M1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Usp20Q8C6M1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Usp20Q8C6M1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp20Q8C6M1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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