Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6B2

Rtkn, Rhotekin, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtknQ8C6B2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RtknQ8C6B2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RtknQ8C6B2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
RtknQ8C6B2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RtknQ8C6B2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RtknQ8C6B2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RtknQ8C6B2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RtknQ8C6B2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RtknQ8C6B2 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RtknQ8C6B2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RtknQ8C6B2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RtknQ8C6B2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RtknQ8C6B2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RtknQ8C6B2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RtknQ8C6B2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RtknQ8C6B2 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RtknQ8C6B2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RtknQ8C6B2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RtknQ8C6B2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RtknQ8C6B2 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RtknQ8C6B2 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RtknQ8C6B2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms