Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Usp38Q8BW70 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Usp38Q8BW70 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms