Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Liat1Q810M6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Liat1Q810M6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms