Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Smim19Q80ZU4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Smim19Q80ZU4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Smim19Q80ZU4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Smim19Q80ZU4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Smim19Q80ZU4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Smim19Q80ZU4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Smim19Q80ZU4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Smim19Q80ZU4 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Smim19Q80ZU4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Smim19Q80ZU4 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Smim19Q80ZU4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Smim19Q80ZU4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Smim19Q80ZU4 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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