Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Tmed3Q78IS1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Tmed3Q78IS1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms